Veri hazırlama
Ham verinin temizlenmesi, yeniden yapılandırılması, değişken kodlama, eksik veri ve tutarlılık kontrolleri.
Tıp ve sağlık bilimleri istatistiği
Verinizin analize hazır olması gerekmez. Veri mimarisi ve kalite kontrolünden ileri istatistiksel modellere, görselleştirmeden manuscript-ready tablo ve grafiklere kadar bütün analiz zinciri tek bir akışta ele alınabilir.
Ana odak tıp, sağlık bilimleri ve biyomedikal araştırmalardır. Aynı istatistiksel çalışma yaklaşımı, uygun veri yapısına sahip diğer akademik ve uygulamalı araştırma alanlarına da uyarlanabilir.
Ham verinin temizlenmesi, yeniden yapılandırılması, değişken kodlama, eksik veri ve tutarlılık kontrolleri.
Tanımlayıcı analizlerden grup karşılaştırmalarına, korelasyonlara ve uygun regresyon modellerine kadar proje odaklı analiz.
Sonuçların açık, yeniden üretilebilir ve sunuma hazır tablo ve vektörel grafik çıktıları halinde hazırlanması.
Nereden başlayacağınızı bilmiyor olabilirsiniz. Araştırma sorusunun netleştirilmesinden örneklem büyüklüğü ve power analizine, veri yapısının kurulmasından son analiz ve görselleştirmeye kadar süreç adım adım ele alınabilir.
Farklı dosyalara dağılmış, değişken adları tutarsız, tekrar ölçümler içeren veya analiz için henüz hazır olmayan veri setleri önce sistematik olarak yapılandırılır. Analize geçmeden önce değişken tipleri, eksik değerler, olası kayıt hataları, tekrarlar, aralık dışı değerler ve tablolar arası tutarlılık kontrol edilir.
Çalışma henüz veri toplama aşamasındaysa örneklem büyüklüğü ve power analizi planlanabilir. Veri toplandıysa araştırma sorusu, sonlanım noktaları, grup yapısı ve veri dağılımına göre uygun testler ve modeller belirlenir.
REDCap, CSV/Excel, SPSS ve benzeri araştırma veri kaynaklarından temiz analiz veri setleri oluşturulabilir. Yetkili erişim ve uygun veri güvenliği koşulları sağlandığında SQL tabanlı veritabanlarından, örneğin DBeaver üzerinden erişilen sistemlerden, doğrudan ve tekrarlanabilir export akışları kurulabilir. Gerektiğinde analiz için uygun import ve veri birleştirme çözümleri hazırlanır.
Aykırı bir değer yalnızca sıra dışı göründüğü için veri setinden çıkarılmaz. Önce veri giriş hatası, ölçüm birimi, cihaz veya laboratuvar kaynağı, klinik/plausibility bilgisi ve ilgili kayıtlar çapraz kontrol edilir. Gerekirse analizler aykırı değer dahil ve hariç olacak şekilde duyarlılık analizleriyle karşılaştırılır.
Büyük veri setlerinde, karmaşık modellerde, kalite kontrolünde ve hızlı revizyonlarda elimizi güçlendiren temel araç R'dir. Kod tabanlı analiz akışı sayesinde verinin ilk kontrolünden nihai tablo ve figürlere kadar her adım izlenebilir ve yeniden üretilebilir.
Tekrarlı ölçümler, çok düzeyli yapılar, eksik ziyaretler, çok sayıda değişken, ileri regresyon modelleri ve özel görselleştirmeler aynı analiz akışı içinde yönetilebilir.
Analiz yalnızca bir sonuç dosyasından ibaret kalmaz. Veri hazırlama, model, kontrast, tablo ve grafik üretimi kodla tanımlandığı için aynı çalışma gerektiğinde aynı kurallarla baştan sona yeniden çalıştırılabilir.
Yeni hasta eklendiğinde, bir değişken düzeltildiğinde veya analiz planı güncellendiğinde bütün tablolar ve grafikler manuel olarak yeniden yapılmak zorunda değildir. Kod tabanlı iş akışı güncellemelerin hızlı ve tutarlı biçimde uygulanmasını sağlar.
DPI, PPI, piksel boyutu, TIFF, PNG, JPEG veya vektörel dosya şartları yayın sürecinin gereksiz yere zaman alan ayrıntılarına dönüşebilir. Analiz figürleri hedef derginin teknik gereksinimlerine göre yeniden üretilebilir ve uygun formatta teslim edilebilir.
Analiz sonuçları ihtiyaç duyduğunuz teslim biçimine göre hazırlanabilir: Word, Excel, LaTeX, HTML, yayın tablosu, sunum görseli veya ek dosya formatları.
TIFF, PNG ve JPEG çıktıları gerekli fiziksel boyut ve 300, 600 veya daha yüksek DPI gereksinimlerine göre üretilebilir. Aynı grafik farklı journal teknik şartnameleri için yeniden export edilebilir.
SVG, PDF ve gerektiğinde EPS gibi vektörel formatlarda çizgiler, yazılar ve noktalar piksele bağlı değildir. Figür büyütüldüğünde keskinliğini kaybetmez. Özellikle çizgi ve nokta ağırlıklı bilimsel grafiklerde dosya boyutu da yüksek çözünürlüklü raster karşılıklarından çok daha küçük olabilir.
Aşağıdaki örnekler tamamen sentetik verilerle oluşturulur. Gerçek hasta veya araştırma verisi içermez. SVG formatı kullanıldığı için grafikler yüksek çözünürlüklü ve küçük dosya boyutludur.
01_ttest_sbp.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda bağımsız iki grup karşılaştırması görünecek.
İki grubun sürekli bir sonuç değişkeni açısından parametrik karşılaştırılmasına örnek.
02_mannwhitney_crp.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda Mann–Whitney U testi görünecek.
Çarpık dağılımlı bir biyobelirtecin iki bağımsız grup arasında karşılaştırılmasına örnek.
03_kruskal_il6.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda Kruskal–Wallis analizi görünecek.
Üç klinik grupta çarpık dağılımlı bir biyobelirtecin genel ve ikili karşılaştırmalarına örnek.
04_correlation_age_pwv.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda korelasyon grafiği görünecek.
İki sürekli değişken arasındaki doğrusal ilişkinin nokta grafiği, güven aralığı ve korelasyon katsayısıyla sunulmasına örnek.
Tıp ve sağlık bilimleri ana uzmanlık alanıdır. Bunun yanında, araştırma sorusu ve veri yapısı uygun olduğunda eğitim bilimleri, temel bilimler, ekonomi ve finans ile mühendislik ve doğa bilimlerinde de istatistiksel analiz yapılabilir. Aşağıdaki örneklerin tamamı sentetik verilerle oluşturulur.
05_education_prepost.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda eğitim bilimleri örneği görünecek.
Aynı katılımcılarda iki zaman noktasındaki sürekli bir sonucun eşleştirilmiş karşılaştırılmasına örnek.
06_basic_science_anova.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda temel bilimler örneği görünecek.
Birden fazla deney koşulunda sürekli bir laboratuvar sonucunun genel ve ikili karşılaştırılmasına örnek.
07_finance_correlation.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda ekonomi ve finans örneği görünecek.
Monoton bir ilişkinin Spearman korelasyon katsayısı ve güven aralığıyla sunulmasına örnek.
08_engineering_strength.svg
R kodu çalıştırıldığında bu alanda mühendislik ve doğa bilimleri örneği görünecek.
Varyansların eşit olması gerekmeyen çoklu grup karşılaştırmasına örnek.
Tekrarlı ölçümlü longitudinal çalışmalarda bazı hastaların bir veya daha fazla ziyareti eksik olabilir. Complete-case yaklaşımı bu hastaların tüm verisini analiz dışına çıkararak örneklemi gereksiz yere daraltabilir. Uygun mixed-effects modeller, mevcut ölçümleri kullanarak dengesiz takip yapılarını doğrudan modelleyebilir.
Linear mixed model gibi yöntemler her hastanın aynı sayıda ölçüme sahip olmasını zorunlu kılmaz. Eksik değerler yapay olarak doldurulmadan, hastanın mevcut ziyaretleri modele katkı sağlayabilir. Eksikliğin mekanizması, model varsayımları ve random-effects yapısı ayrıca değerlendirilir.
Bu yaklaşım eksik verinin otomatik olarak “çözüldüğü” anlamına gelmez; yöntemin geçerliliği missingness varsayımına ve model spesifikasyonuna bağlıdır.
Modelin neden seçildiği, hangi sabit ve rassal etkilerin kullanıldığı, kontrastların nasıl kurulduğu, çoklu karşılaştırmaların nasıl düzeltildiği ve eksik ziyaretlerin nasıl ele alındığı analiz kaydında korunur. Böylece Methods bölümündeki istatistiksel gerekçelendirme veya istatistiksel hakem soruları sırasında kararların matematiksel ve metodolojik dayanağı yeniden gösterilebilir.
17_health_lmm.svg
R kodu çalıştırıldığında EMM, %95 güven aralıkları ve interaction p değeriyle longitudinal LMM grafiği burada görünecek.
Dengesiz takip verisinde estimated marginal means, %95 güven aralıkları ve zaman × grup etkileşiminin birlikte sunulmasına örnek.
18_health_lmm_table.svg
R kodu çalıştırıldığında her visit için kontrol ve girişim koluna ait EMM, %95 GA ve gruplar arası p değeri tek satırda burada görünecek.
Her visit için kontrol ve girişim kollarına ait model-tabanlı ortalamaların ve aynı visit içindeki gruplar arası p değerinin tek satırda sunulmasına örnek.
19_health_lmm_within_table.svg
R kodu çalıştırıldığında baseline'a göre grup içi değişim kontrastları burada görünecek.
Her tedavi kolunda baseline'a göre izlem ziyaretlerindeki değişimlerin ayrı bir yayın tablosu halinde verilmesine örnek.
Her araştırma sorusu klasik bir grup karşılaştırmasıyla cevaplanmaz. Boylamsal süreçler, aracılık mekanizmaları, zaman içindeki geçişler, çok değişkenli örüntüler ve deneysel optimizasyon için daha ileri modeller ve görselleştirmeler kullanılabilir.
09_health_sankey.svg
R kodu çalıştırıldığında çok aşamalı akışları gösteren Sankey diyagramı burada görünecek.
Üretici, aracı, işleyici ve son kullanıcı katmanları gibi çok aşamalı geçiş verilerinin anlaşılır biçimde gösterilmesine örnek.
10_health_radar.svg
R kodu çalıştırıldığında spider/radar grafiği burada görünecek.
Birden fazla klinik alanın ortak bir ölçeğe getirilerek gruplar arasında bütüncül olarak karşılaştırılmasına örnek.
11_health_survival.svg
R kodu çalıştırıldığında Kaplan-Meier analizi burada görünecek.
Takip süresi ve sansürlemeyi dikkate alan olay-zaman verisinin Kaplan-Meier eğrileri ve log-rank testiyle sunulmasına örnek.
20_health_consort.svg
R kodu çalıştırıldığında standart mavi başlıklı CONSORT tarzı katılımcı akış diyagramı burada görünecek.
Tarama, dışlama, randomizasyon, takip kayıpları ve analiz popülasyonunun standart CONSORT düzeninde sunulmasına örnek.
12_education_mediation.svg
R kodu çalıştırıldığında iyileştirilmiş mediation analysis görseli burada görünecek.
Türkçe başarısının fen başarısıyla ilişkisi doğrudan mı, yoksa matematik başarısı üzerinden kısmen dolaylı mı? Doğrudan, dolaylı ve toplam etkilerin temiz ve yayın sunumuna uygun biçimde ayrıştırılmasına örnek.
13_basic_dose_response.svg
R kodu çalıştırıldığında jitter/dodge ile iyileştirilmiş nonlinear dose-response modeli burada görünecek.
Deneysel konsantrasyon ile biyolojik yanıt arasındaki doğrusal olmayan ilişkinin, tekrar ölçümleri ayrıştırılarak modellenmesine örnek.
14_basic_pca.svg
R kodu çalıştırıldığında PCA biplot burada görünecek.
Birden fazla laboratuvar belirtecinin birlikte değerlendirilmesi ve örneklerin düşük boyutlu uzayda görselleştirilmesine örnek.
21_genomics_heatmap.svg
R kodu çalıştırıldığında genomik heatmap burada görünecek.
Vaka ve kontrol örneklerinde seçilmiş genlerin z-skor düzeyindeki örüntülerinin yüksek okunabilirlikle sunulmasına örnek.
22_genomics_volcano.svg
R kodu çalıştırıldığında genomik volcano plot burada görünecek.
Kat değişimi ve çoklu karşılaştırma sonrası anlamlılığın tek bakışta değerlendirilebildiği genomik sonuç sunumuna örnek.
15_economics_interrupted_ts.svg
R kodu çalıştırıldığında interrupted time series analizi burada görünecek.
Bir politika veya olay sonrasında seviyede ve eğimde meydana gelen değişimin karşı-olgusal trend ile birlikte modellenmesine örnek.
16_engineering_response_surface.svg
R kodu çalıştırıldığında response surface analizi burada görünecek.
Sıcaklık ve basınç gibi iki sürekli faktörün çıktı üzerindeki doğrusal olmayan ve etkileşimli etkilerinin yüzey modeliyle incelenmesine örnek.
Her proje aynı temel kontrol akışıyla yürütülür. Analiz başlamadan önce veri bütünlüğü, araştırma sorusu, yöntem ve teslim edilecek çıktılar netleştirilir.
Dosyalar ve değişken açıklamaları alınır.
Veri yapısı ve kalite sorunları belirlenir.
Araştırma sorusuna uygun analiz planı belirlenir.
Testler, modeller, tablolar ve grafikler hazırlanır.
Sayısal tutarlılık kontrolü sonrası çıktılar teslim edilir.
Bu sitedeki tüm analiz örnekleri sentetiktir. Gerçek proje verileri web sitesinde yayınlanmaz. Proje verilerinin aktarım yöntemi çalışma başlamadan önce ayrıca belirlenir.
İletişim
Veri yapısı, araştırma sorusu ve beklenen çıktılar hakkında kısa bilgi yeterlidir.
info@temizanaliz.com