Tıp ve sağlık bilimleri istatistiği

Ham veriden denetlenebilir, anlaşılır ve yayına hazır istatistiksel sonuçlara.

Verinizin analize hazır olması gerekmez. Veri mimarisi ve kalite kontrolünden ileri istatistiksel modellere, görselleştirmeden manuscript-ready tablo ve grafiklere kadar bütün analiz zinciri tek bir akışta ele alınabilir.

Hizmetler

Ana odak tıp, sağlık bilimleri ve biyomedikal araştırmalardır. Aynı istatistiksel çalışma yaklaşımı, uygun veri yapısına sahip diğer akademik ve uygulamalı araştırma alanlarına da uyarlanabilir.

Veri hazırlama

Ham verinin temizlenmesi, yeniden yapılandırılması, değişken kodlama, eksik veri ve tutarlılık kontrolleri.

İstatistiksel analiz

Tanımlayıcı analizlerden grup karşılaştırmalarına, korelasyonlara ve uygun regresyon modellerine kadar proje odaklı analiz.

Tablo ve grafikler

Sonuçların açık, yeniden üretilebilir ve sunuma hazır tablo ve vektörel grafik çıktıları halinde hazırlanması.

Veriniz hazır olmak zorunda değil

Nereden başlayacağınızı bilmiyor olabilirsiniz. Araştırma sorusunun netleştirilmesinden örneklem büyüklüğü ve power analizine, veri yapısının kurulmasından son analiz ve görselleştirmeye kadar süreç adım adım ele alınabilir.

Karmaşık ve dağınık veri sorun değil

Farklı dosyalara dağılmış, değişken adları tutarsız, tekrar ölçümler içeren veya analiz için henüz hazır olmayan veri setleri önce sistematik olarak yapılandırılır. Analize geçmeden önce değişken tipleri, eksik değerler, olası kayıt hataları, tekrarlar, aralık dışı değerler ve tablolar arası tutarlılık kontrol edilir.

Power analizi ve analiz planı

Çalışma henüz veri toplama aşamasındaysa örneklem büyüklüğü ve power analizi planlanabilir. Veri toplandıysa araştırma sorusu, sonlanım noktaları, grup yapısı ve veri dağılımına göre uygun testler ve modeller belirlenir.

REDCap, Excel, SPSS ve veritabanları

REDCap, CSV/Excel, SPSS ve benzeri araştırma veri kaynaklarından temiz analiz veri setleri oluşturulabilir. Yetkili erişim ve uygun veri güvenliği koşulları sağlandığında SQL tabanlı veritabanlarından, örneğin DBeaver üzerinden erişilen sistemlerden, doğrudan ve tekrarlanabilir export akışları kurulabilir. Gerektiğinde analiz için uygun import ve veri birleştirme çözümleri hazırlanır.

Her sıra silinecek bir “outlier” değildir

Aykırı bir değer yalnızca sıra dışı göründüğü için veri setinden çıkarılmaz. Önce veri giriş hatası, ölçüm birimi, cihaz veya laboratuvar kaynağı, klinik/plausibility bilgisi ve ilgili kayıtlar çapraz kontrol edilir. Gerekirse analizler aykırı değer dahil ve hariç olacak şekilde duyarlılık analizleriyle karşılaştırılır.

Toplanan her veri emektir. Her gözlem; araştırmacı, asistan, teknisyen ve klinik ekip tarafından sahada harcanan zamanın ürünüdür. Amaç veriyi kolayca elemek değil, mümkün olan her durumda kaynağını anlamak, doğrulamak ve bilimsel olarak kullanılabilir hale getirmektir.

Analiz altyapısı: R

Büyük veri setlerinde, karmaşık modellerde, kalite kontrolünde ve hızlı revizyonlarda elimizi güçlendiren temel araç R'dir. Kod tabanlı analiz akışı sayesinde verinin ilk kontrolünden nihai tablo ve figürlere kadar her adım izlenebilir ve yeniden üretilebilir.

Karmaşık analizler

Tekrarlı ölçümler, çok düzeyli yapılar, eksik ziyaretler, çok sayıda değişken, ileri regresyon modelleri ve özel görselleştirmeler aynı analiz akışı içinde yönetilebilir.

Yeniden üretilebilirlik

Analiz yalnızca bir sonuç dosyasından ibaret kalmaz. Veri hazırlama, model, kontrast, tablo ve grafik üretimi kodla tanımlandığı için aynı çalışma gerektiğinde aynı kurallarla baştan sona yeniden çalıştırılabilir.

Hızlı ve kontrollü revizyon

Yeni hasta eklendiğinde, bir değişken düzeltildiğinde veya analiz planı güncellendiğinde bütün tablolar ve grafikler manuel olarak yeniden yapılmak zorunda değildir. Kod tabanlı iş akışı güncellemelerin hızlı ve tutarlı biçimde uygulanmasını sağlar.

R'nin öğrenme eğrisi diktir; avantajı tam da buradadır. İstatistiksel modelleme ve programatik raporlama için geniş bir ekosistem sunar. İyi kurulmuş bir R çalışma akışı, karmaşık analizlerin denetlenmesini, standartlaştırılmasını ve yüksek estetikte düzenli raporlanmasını mümkün kılar.

Figür teknik şartlarıyla siz uğraşmayın

DPI, PPI, piksel boyutu, TIFF, PNG, JPEG veya vektörel dosya şartları yayın sürecinin gereksiz yere zaman alan ayrıntılarına dönüşebilir. Analiz figürleri hedef derginin teknik gereksinimlerine göre yeniden üretilebilir ve uygun formatta teslim edilebilir.

Analiz sonuçları ihtiyaç duyduğunuz teslim biçimine göre hazırlanabilir: Word, Excel, LaTeX, HTML, yayın tablosu, sunum görseli veya ek dosya formatları.

Raster çıktılar

TIFF, PNG ve JPEG çıktıları gerekli fiziksel boyut ve 300, 600 veya daha yüksek DPI gereksinimlerine göre üretilebilir. Aynı grafik farklı journal teknik şartnameleri için yeniden export edilebilir.

TIFF PNG JPEG 300 DPI 600 DPI 1200 DPI

Çözünürlükten bağımsız vektör grafikler

SVG, PDF ve gerektiğinde EPS gibi vektörel formatlarda çizgiler, yazılar ve noktalar piksele bağlı değildir. Figür büyütüldüğünde keskinliğini kaybetmez. Özellikle çizgi ve nokta ağırlıklı bilimsel grafiklerde dosya boyutu da yüksek çözünürlüklü raster karşılıklarından çok daha küçük olabilir.

SVG PDF EPS Resolution-independent

Tıp ve sağlık bilimlerinden örnek analizler

Aşağıdaki örnekler tamamen sentetik verilerle oluşturulur. Gerçek hasta veya araştırma verisi içermez. SVG formatı kullanıldığı için grafikler yüksek çözünürlüklü ve küçük dosya boyutludur.

Bağımsız iki grup için t testi örneği
Welch t testi İki bağımsız grup

Kan basıncı karşılaştırması

İki grubun sürekli bir sonuç değişkeni açısından parametrik karşılaştırılmasına örnek.

Mann Whitney U testi örneği
Mann–Whitney U Nonparametrik

CRP dağılımı

Çarpık dağılımlı bir biyobelirtecin iki bağımsız grup arasında karşılaştırılmasına örnek.

Kruskal Wallis testi örneği
Kruskal–Wallis Çoklu grup

IL-6 düzeyleri

Üç klinik grupta çarpık dağılımlı bir biyobelirtecin genel ve ikili karşılaştırmalarına örnek.

Korelasyon analizi örneği
Pearson korelasyonu Sürekli değişkenler

Yaş ve arteriyel sertlik

İki sürekli değişken arasındaki doğrusal ilişkinin nokta grafiği, güven aralığı ve korelasyon katsayısıyla sunulmasına örnek.

Diğer çalışma alanları

Tıp ve sağlık bilimleri ana uzmanlık alanıdır. Bunun yanında, araştırma sorusu ve veri yapısı uygun olduğunda eğitim bilimleri, temel bilimler, ekonomi ve finans ile mühendislik ve doğa bilimlerinde de istatistiksel analiz yapılabilir. Aşağıdaki örneklerin tamamı sentetik verilerle oluşturulur.

Eğitim bilimlerinde eşleştirilmiş ölçüm analizi örneği
Eğitim bilimleri Paired t test

Eğitim öncesi ve sonrası başarı puanı

Aynı katılımcılarda iki zaman noktasındaki sürekli bir sonucun eşleştirilmiş karşılaştırılmasına örnek.

Temel bilimlerde tek yönlü varyans analizi örneği
Temel bilimler One-way ANOVA

Deney gruplarında enzim aktivitesi

Birden fazla deney koşulunda sürekli bir laboratuvar sonucunun genel ve ikili karşılaştırılmasına örnek.

Ekonomi ve finansta korelasyon analizi örneği
Ekonomi & finans Spearman korelasyonu

Risk ve yıllık getiri ilişkisi

Monoton bir ilişkinin Spearman korelasyon katsayısı ve güven aralığıyla sunulmasına örnek.

Mühendislikte malzeme dayanımı karşılaştırması örneği
Mühendislik & doğa bilimleri Welch ANOVA

Malzeme gruplarında çekme dayanımı

Varyansların eşit olması gerekmeyen çoklu grup karşılaştırmasına örnek.

Bir visit eksik diye bir hastayı kaybetmek zorunda değilsiniz

Tekrarlı ölçümlü longitudinal çalışmalarda bazı hastaların bir veya daha fazla ziyareti eksik olabilir. Complete-case yaklaşımı bu hastaların tüm verisini analiz dışına çıkararak örneklemi gereksiz yere daraltabilir. Uygun mixed-effects modeller, mevcut ölçümleri kullanarak dengesiz takip yapılarını doğrudan modelleyebilir.

Mevcut bilgiyi koruyan analiz

Linear mixed model gibi yöntemler her hastanın aynı sayıda ölçüme sahip olmasını zorunlu kılmaz. Eksik değerler yapay olarak doldurulmadan, hastanın mevcut ziyaretleri modele katkı sağlayabilir. Eksikliğin mekanizması, model varsayımları ve random-effects yapısı ayrıca değerlendirilir.

Bu yaklaşım eksik verinin otomatik olarak “çözüldüğü” anlamına gelmez; yöntemin geçerliliği missingness varsayımına ve model spesifikasyonuna bağlıdır.

Methods'tan hakem sorularına kadar izlenebilirlik

Modelin neden seçildiği, hangi sabit ve rassal etkilerin kullanıldığı, kontrastların nasıl kurulduğu, çoklu karşılaştırmaların nasıl düzeltildiği ve eksik ziyaretlerin nasıl ele alındığı analiz kaydında korunur. Böylece Methods bölümündeki istatistiksel gerekçelendirme veya istatistiksel hakem soruları sırasında kararların matematiksel ve metodolojik dayanağı yeniden gösterilebilir.

Eksik ziyaretler içeren longitudinal veri için linear mixed model grafiği
Longitudinal data Linear mixed model Missing visits

Zaman × grup modeli

Dengesiz takip verisinde estimated marginal means, %95 güven aralıkları ve zaman × grup etkileşiminin birlikte sunulmasına örnek.

Linear mixed model estimated marginal means ve gruplar arası farklar tablosu
EMM + 95% CI Between-group Adjusted p values

Gruplar arası model tablosu

Her visit için kontrol ve girişim kollarına ait model-tabanlı ortalamaların ve aynı visit içindeki gruplar arası p değerinin tek satırda sunulmasına örnek.

Linear mixed model grup içi değişim tablosu
Within-group Baseline contrasts Holm adjusted

Grup içi değişim tablosu

Her tedavi kolunda baseline'a göre izlem ziyaretlerindeki değişimlerin ayrı bir yayın tablosu halinde verilmesine örnek.

İleri analizler ve görselleştirmeler

Her araştırma sorusu klasik bir grup karşılaştırmasıyla cevaplanmaz. Boylamsal süreçler, aracılık mekanizmaları, zaman içindeki geçişler, çok değişkenli örüntüler ve deneysel optimizasyon için daha ileri modeller ve görselleştirmeler kullanılabilir.

Tıp & sağlık

Mixed models Survival ROC / AUC Longitudinal Logistic regression Sankey Spider / radar CONSORT flowchart

Eğitim bilimleri

Mediation Multilevel models Repeated measures Reliability Factor analysis SEM

Temel bilimler

Dose-response ANOVA PCA Clustering Correlation matrices Heatmap Volcano plot Nonlinear models

Ekonomi & finans

Time series Interrupted time series Panel models Quantile regression Forecasting Risk-return

Mühendislik & doğa bilimleri

DOE Response surface Reliability PCA Optimization Regression
Çok aşamalı akış için Sankey diyagramı
Tıp & sağlık Sankey / alluvial

Çok aşamalı akışların sade sunumu

Üretici, aracı, işleyici ve son kullanıcı katmanları gibi çok aşamalı geçiş verilerinin anlaşılır biçimde gösterilmesine örnek.

Klinik çok boyutlu profil için radar grafiği
Tıp & sağlık Spider / radar

Çok boyutlu klinik profil

Birden fazla klinik alanın ortak bir ölçeğe getirilerek gruplar arasında bütüncül olarak karşılaştırılmasına örnek.

Kaplan Meier sağkalım analizi
Tıp & sağlık Kaplan-Meier

Olay-zaman analizi

Takip süresi ve sansürlemeyi dikkate alan olay-zaman verisinin Kaplan-Meier eğrileri ve log-rank testiyle sunulmasına örnek.

CONSORT tarzı akış şeması
Tıp & sağlık CONSORT flowchart

Katılımcı akış diyagramı

Tarama, dışlama, randomizasyon, takip kayıpları ve analiz popülasyonunun standart CONSORT düzeninde sunulmasına örnek.

Türkçe matematik ve fen başarısı için mediation analysis
Eğitim bilimleri Mediation analysis

Türkçe → Matematik → Fen

Türkçe başarısının fen başarısıyla ilişkisi doğrudan mı, yoksa matematik başarısı üzerinden kısmen dolaylı mı? Doğrudan, dolaylı ve toplam etkilerin temiz ve yayın sunumuna uygun biçimde ayrıştırılmasına örnek.

Doz yanıt eğrisi
Temel bilimler Nonlinear model

Doz-yanıt eğrisi ve EC50

Deneysel konsantrasyon ile biyolojik yanıt arasındaki doğrusal olmayan ilişkinin, tekrar ölçümleri ayrıştırılarak modellenmesine örnek.

Temel bilimlerde PCA biplot
Temel bilimler PCA

Çok değişkenli örüntülerin ayrıştırılması

Birden fazla laboratuvar belirtecinin birlikte değerlendirilmesi ve örneklerin düşük boyutlu uzayda görselleştirilmesine örnek.

Gen ifade örüntüleri için heatmap
Genomik Heatmap

Gen ifade örüntülerinin heatmap sunumu

Vaka ve kontrol örneklerinde seçilmiş genlerin z-skor düzeyindeki örüntülerinin yüksek okunabilirlikle sunulmasına örnek.

Diferansiyel ifade analizi için volcano plot
Genomik Volcano plot

Diferansiyel ifade analizi için volcano plot

Kat değişimi ve çoklu karşılaştırma sonrası anlamlılığın tek bakışta değerlendirilebildiği genomik sonuç sunumuna örnek.

Interrupted time series analizi
Ekonomi & finans Interrupted time series

Müdahale öncesi ve sonrası trend

Bir politika veya olay sonrasında seviyede ve eğimde meydana gelen değişimin karşı-olgusal trend ile birlikte modellenmesine örnek.

Mühendislik response surface analizi
Mühendislik & doğa bilimleri Response surface

İki proses parametresiyle optimizasyon

Sıcaklık ve basınç gibi iki sürekli faktörün çıktı üzerindeki doğrusal olmayan ve etkileşimli etkilerinin yüzey modeliyle incelenmesine örnek.

Çalışma süreci

Her proje aynı temel kontrol akışıyla yürütülür. Analiz başlamadan önce veri bütünlüğü, araştırma sorusu, yöntem ve teslim edilecek çıktılar netleştirilir.

Veri

Dosyalar ve değişken açıklamaları alınır.

Kontrol

Veri yapısı ve kalite sorunları belirlenir.

Plan

Araştırma sorusuna uygun analiz planı belirlenir.

Analiz

Testler, modeller, tablolar ve grafikler hazırlanır.

QC ve teslim

Sayısal tutarlılık kontrolü sonrası çıktılar teslim edilir.

Veri gizliliği ve örnek veriler

Bu sitedeki tüm analiz örnekleri sentetiktir. Gerçek proje verileri web sitesinde yayınlanmaz. Proje verilerinin aktarım yöntemi çalışma başlamadan önce ayrıca belirlenir.

İletişim

Projenizi kısaca anlatın.

Veri yapısı, araştırma sorusu ve beklenen çıktılar hakkında kısa bilgi yeterlidir.

info@temizanaliz.com